专家质询评估模式侧重于对预算的真实性审核，专家对提交的软件预算材料（包括初步评估的预算结果）进行初审，然后以集体形式在预算评估会议中确定最终的软件预算额度。专家质询评估模式多用于上级单位对下级单位所提交软件预算的审核，也适用于甲方单位对乙方单位提交的软件进行预算审核。专家质询评估模式通常会遵循一定的流程，下面是一种比较有代表性的专家质询评估的工作流程。

1)      提交预算材料 召开软件成本评估质询会之前，先要由被评估人提交初步完成的软件项目预算表以及相关的支持材料，例如软件项目的业务需求说明书、软件工作量估算表、软件项目初始WBS等相关文档。如果所提交的材料符合要求，则会安排该项目参加专家质询会。如果材料不符合，则重新提交材料，直至符合为止。

2)      预算材料审核 成本评估质询会主持人将符合要求的评估材料发送给相应的评估专家提前审核，以便专家在参加质询会之前熟悉评估材料并提出可能的疑问。

3)      项目情况说明 在召开软件成本评估质询会时，首先请被评估人就提交的初步预算结果以及相关的支持材料进行简要说明，重点在于说明根据评估人所提交的评估材料能够以客观、合理的方式得到初步预算结果。

4)      回答专家问题 完成项目情况说明后，评估专家就自己关心的问题或者疑问请被评估人做出说明，被评估人应尽量避免过于主观的解释，例如，“我认为”、“我猜测”以及“根据我们的经验”等主观色彩过于浓厚的解释通常不会有说服力，而那些能够举出实例或者给出客观数据的澄清方式则是评估专家认可的方式。

5)      专家现场打分 完成问题澄清环节后，就进入软件成本质询会的关键环节——专家现场打分。专家结合自己对评估材料的理解，并结合被评估人的讲解以及对有关问题的澄清结果等，独立给出软件预算评估结果。专家质询评估法通常对于评估专家的人数有一定的要求，例如至少为七人[1]。在计算最终的预算结果时，通常会去掉预算评估结果的最高值和最小值，然后计算其余数值的算术平均值，该结果即作为预算的最终结果。

6)      通知评估结果 专家完成现场打分后即退场，由软件预算评估主持人向被评估人宣布预算结果。如果被评估人接受专家的预算评估结果，则该次会议结束，软件项目后续的开发或维护预算均以此次评估会与评估的预算为准；如果被评估人对于专家评估的预算结果有异议，可以申请复评。

7）复评 复评申请时需要重新提交申请材料，如果所提交的预算评估材料与之前提交的材料没有实质性差异，则软件预算评估主持人可以拒绝复评申请。软件预算的最终结果以前一次评估的结果为准；如果复评申请被批准，则遵循专家质询评估模式重新对软件预算进行评估。